I

Мною был выбран метаболизм витамина B6. На рисунке ниже показан сам метаболический путь: 

Далее мне риглянулась реакция EC:3.1.3.74. В ней осуществляется фосфорилирование пиридоксамина, пиродоксаля и пиродоксина. Ниже представлена схема данной реакции.

Эту реакцию осуществляют два ортологичных ряда ферметов: K07758 (23 белка) и K13248 (218 белков).

II

Мною были получены последовательности рядов K07758 и K13248. А вот они же, только уже выравненные. Из представленного выравнивания уже были удалены «лишние», «мусорные» последовательности, которые мешали построить филогенетическое дерево. Так, было несколько последовательностей, которые были явными обрубками и имели очень маленькую длину. На рисунке выравнивания (см. ниже) видно, что нет чётко выраженных гомологичных блоков, поэтому, скорее всего, два этих ортологичных ряда негомологичны. Особенно сильно видно чёткую разницу между первым кластером и вторым (первые 15 последовательностей), поэтому я не вижу смысла строить дерево и реконструировать филогению по этим белкам.