| |
Занятие 2. Банк EMBL
-
Сравнение разных записей в EMBL
|
Идентификатор записи EMBL
|
Тип молекулы
|
Класс данных
|
Раздел EMBL
|
Дата создания
документа |
Описание
|
Длина последовательности
|
| AP009048 |
genomic DNA |
STD |
PRO |
22-JAN-2006 |
Escherichia coli W3110 DNA, complete genome |
4646332 |
| K01299 |
genomic DNA |
STD |
PRO |
13-JUN-1985 |
E.coli phr gene coding for deoxyribopyrimidine photolyase |
2039 |
| U00096 |
genomic DNA |
STD |
PRO |
23-FEB-2006 |
Escherichia coli K12 MG1655, complete genome |
4639675 |
| X57399 |
genomic DNA |
STD |
PRO |
11-NOV-1992 |
E.coli phr gene for DNA photolyase, exon 1 |
1475 |
Записей оказалось всего 4, 2 из которых оказались полными геномами разных штаммов E.Coli. Класс, раздел EMBL и тип молекулы у всех одинаковы.
-
Сравнение описаний гена Escherichia coli в двух разных записях EMBL
| |
I |
II |
| ID записи |
K01299 |
X57399 |
| Начало гена в записи |
544 |
48 |
| Конец гена в записи |
1962 |
1466 |
| Направление гена |
прямое |
прямое |
| Примечания* |
mat_peptide |
exon |
Совпадение при использовании программы needle 100%. Абсолютно одинаковые последовательности.
-
Знакомство с записью гена /product="GNB2" из фрагмента эукариотического генома AF053356
|