AC домена - PF11521, summary name - C-terminal general transcription factor TFIIE alpha. Число последовательностей seed - 23, full = 1403. Ссылка на таблицу excel тут.

3D структура домена состоит из 2-х бета-листов и 3 альфа-спиралей, фрагмент TFIIEa способен самостоятельно стимулировать транскрипцию в клетках in vivo, а с-концевой домен напрямую влияет на скорость и точность синтеза RNA Poll II, т.е. на скорость деления и выживание клеток.

Таксономическая распространённость домена - metazoa - 1733, fungi -175; no kingdom - 23. (eukaryota - 1933)

Рис 1. Карта локального сходства O96880 и Q91859.

Единственный непрерывный блок выравнивания – это «ядро» домена, общего для обоих белков, примерно до 270 а.к., но строго говоря до 230 а.к. Далее уже появляются конкретные для каждой доменной архитектуры сайты белков, увеличивается число инделов в выравнивании и возрастают разницы в а.к. Однако в целом локальное сходство получилось очень хорошим, небольшое количество делеций, отсутствие инверсий, дупликаций, сравнительно небольшое количество транслокаций.