Главная
Учебные материалы
Метка поля COAA_ECOLI PANK_YEAST
Первый код доступа AC P0A6I3 Q04430
Идентификатор последовательности в БД ID COAA_ECOLI PANK_YEAST
Название (краткое описание) белка DE Pantothenate kinase (EC 2.7.1.33) (Pantothenic acid kinase) (Rts protein) Pantothenate kinase (EC 2.7.1.33) (Pantothenic acid kinase)
Дата создания документа DT 29-MAR-2005, integrated into UniProtKB/Swiss-Prot.
17-OCT-2006, integrated into UniProtKB/Swiss-Prot
Дата последнего исправления аннотации DT 05-FEB-2008, entry version 36 15-JAN-2008, entry version 46
Название организма OS Escherichia coli (strain K12) Saccharomyces cerevisiae (Baker's yeast)
Классификация организма (список таксонов) OC Bacteria; Proteobacteria; Gammaproteobacteria; Enterobacteriales; Enterobacteriaceae; Escherichia. Eukaryota; Fungi; Dikarya; Ascomycota; Saccharomycotina; Saccharomycetes; Saccharomycetales; Saccharomycetaceae; Saccharomyces
Длина последовательности ID,FT,SQ 316 AA 367 AA
Молекулярная масса белка SQ 36360 40903
Число публикаций, использованных при создании документа RN 6 3
Журнал и год самой поздней публикации RL Mol. Syst. Biol. 2:E1-E5(2006) Nature 425:737-741(2003)
Описание вторичной структуры
Укажите, есть ли такое описание, и в чем оно состоит.
FT
Да, описание всех вторичных структур по типу
Type     First residue  Last residue
TURN     164            166
NP_BIND  95		102
Нет
Ключевые слова KW 3D-structure; ATP-binding; Coenzyme A biosynthesis; Complete proteome; Cytoplasm; Kinase; Nucleotide-binding; Transferase. ATP-binding; Coenzyme A biosynthesis; Complete proteome; Cytoplasm; Kinase; Nucleotide-binding; Nucleus; Transferase.
Темы, освещённые в комментариях СС CATALYTIC ACTIVITY (Каталитическая активность); ENZYME REGULATION (Ферментативная регуляция); PATHWAY (Путь превращения) ;SUBCELLULAR LOCATION (Положение в клетке); SIMILARITY (Сродство к другим белкам). FUNCTION;CATALYTIC ACTIVITY(Каталитическая активность);ENZYME REGULATION (Ферментативная регуляция); PATHWAY (Путь превращения) ;INTERACTION (Взимосвязь с другими белками (?));SUBCELLULAR LOCATION(Положение в клетке);MISCELLANEOUS(Различные дополнительные сведения);SIMILARITY(Сродство к другим белкам).
Особенности последовательности
Не копируйте, а перечислите, какие особенности отражены в документе!FT
FT Наличие NP_Bind (сайт связывания ATP) Наличие NP_Bind (сайт связывания ATP)
Идентификаторы записей PDB DR 1ESM;1ESN;1SQ5 Отсутствует
Записи P0A6I3 и Q04430
К сожалению я не могу сделать выводов о похожести последовательностей, так как
Во-первых: Отличаются длины последовательностей (316 против 367)
Во-вторых: В записи Q04430 отсутсвует описание объектов вторичной структуры, соответсвенно нельзя сравнить количество/состав/размеры/взаимное расположение объектов, также у записи Q04430 отсуствует идентификатор PDB.
В-третьих: Хотя из описаний белков можно сделать вывод о наличии в обеих последовательностях сайта свзяывания ATP, однако по всей видимости они значительно отличаются по аминокислотному составу.
Результаты выполнения команд:
entret sw:P0A6I3 -auto
-bash: entret: command not found (проблема в ПО сервера мб?)
wget http://www.expasy.ch/uniprot/Q04430
файл удачно сохранен в рабочей директории
©Залевский, Артур, 2007