практикум №6

KEGG, GO

Базы данных функций белков.


Анализируемые белки

В предложенном для анализа списке генов человека, кодирующих ферменты, содержится 7 идентификаторов. Общей характеристикой этих ферментов является специфичность к фосфосодержащим субстратам и, видимо, участие в метаболизме холинов и/или липидов.

Таблица 1. Информация об анализируемых белках.
ID гена Название Локализация кодируемого белка Функция кодируемого белка
GDPD1 Глицерофосфодиэфирная фосфодиэстераза, содержащая домен 1 Цитоплазма Гидролиз деацилированных глицерофосфолипидов до глицерофосфата и спирта.
GDE1 Глицерофосфодиэстераза 1 Мембрана Предполагается, что участвует в метаболизме N-ацилэтаноламинов, метаболизме этаноламинов и метаболизме фосфолипидов.
GDPD3 Глицерофосфодиэстераза, содержащая домен 3 Эндоплазматический ретикулум Обеспечивает активность фосфодиэстеразы. Участвует в метаболизме N-ацилэтиламина.
PNPLA6 Пататиноподобный фосфолипазный доменсодержащий белок 6 Эндоплазматический ретикулум Деацетилирует внутриклеточный фосфатидилхолин с образованием глицерофосфохолина.
GDPD5 Глицерофосфодиэфирная фосфодиэстераза, содержащая домен 5 Эндоплазматический ретикулум, мембрана Предполагается, что обеспечивает активность глицерофосфодиэстеразы.
PNPLA7 Пататиноподобный фосфолипазный доменсодержащий белок 7 Эндоплазматический ретикулум Отвечает за превращение лизофосфатидилхолина в глицерофосфохолин в печеночном фосфатидилхолин-катаболическом пути. [1]
ENPP6 Эктонуклеотидная пирофосфатаза/фосфодиэстераза 6 Мембрана Обеспечивает активность глицерофосфохолин-холинфосфодиэстеразы.

База данных 1

текст

База данных 2

текст


Источники

  1. Harada, S.; Taketomi, Y.; Aiba, T.; Kawaguchi, M.; Hirabayashi, T.; Uranbileg, B.; Kurano, M.; Yatomi, Y.; Murakami, M. The Lysophospholipase PNPLA7 Controls Hepatic Choline and Methionine Metabolism. Biomolecules 2023, 13, 471. https://doi.org/10.3390/biom13030471