Практикум 10
log-файл Prepare log-файл MakepangenomeЧисло блоков составляет 406. Размер нуклеотидного ядра 86.11%. Процент консервативных колонок в объединённом выравнивании s-блоков 94.6%, так что можно сказать, что геномы довольно схожи между собой.
| геном | имя блока, подтверждающего делецию | длина делеции | имена делятированных генов |
|---|---|---|---|
| MT51 | h3x10923 | 10923 | VirB3 type IV secretion protein, VirB4-like protein, DNA topoisomerase I (topA) |
Была найдена перестановка синтений. В геномах ATCC, FDAA и NCTC g4x100 стоит напротив блока g4x5386 у MT51. После справа стоят во всех геномах блоки g4x18088, g4x85232 только у MT51, g4x3416 у всех, и только потом g4x100 у MT51. Таким образом, на картинке можно увидеть данную перестановку блока g4x100.
