Особенности моего белка - в его вторичной структуре. Белок представляет собой тример с порой посередине, поэтому расположение спиралей и тяжей играет ключевую роль:
Key Begin End Length Description RESID INIT_MET 1 1 1 Removed. CHAIN 2 125 124 RutC family protein yabJ. /FTId=PRO_0000170330. STRAND 3 5 3 STRAND 18 23 6 STRAND 26 29 4 HELIX 46 63 18 HELIX 68 70 3 STRAND 71 79 9 HELIX 81 83 3 HELIX 84 94 11 STRAND 95 97 3 STRAND 101 106 6 HELIX 111 113 3 STRAND 115 123 9
Последовательность: MTKAVHTKHA PAAIGPYSQG IIVNNMFYSS GQIPLTPSGE MVNGDIKEQT HQVFSNLKAV
LEEAGASFET VVKATVFIAD MEQFAEVNEV YGQYFDTHKP ARSCVEVARL PKDALVEIEV
IALVK
Подходящая структура только одна - собственно, моего белка (1QD9 в PDB). Список из этой одной структуры сохранен в файл.
| Формулировка функции белка | Строка запроса | Количество найденных документов | |
| PurR & repressor (All text) | ([swissprot-AllText:PurR*] & [swissprot-AllText:repressor*]) | 96 | |
| PurR & repressor (Description) | ([swissprot-Description:PurR*] & [swissprot-Description:repressor*]) | 88 | |
| PurR & repressor ! fragment (Description) | (([swissprot-Description:PurR*] & [swissprot-Description:repressor*]) ! [swissprot-Description:fragment*]) | 88 | |
| PurR & regulator ! fragment (Description) | (([swissprot-Description:PurR*] & [swissprot-Description:regulator*]) ! [swissprot-Description:fragment*]) | 0 | |
| RutC family protein ! fragment (Description) | ([swissprot-Description:RutC family protein*] ! [swissprot-Description:fragment*]) | 27 | |
| purA repressor | (([swissprot-AllText:purA*] & [swissprot-AllText:repressor*]) | [swissprot-AllText:purA repressor*]) | 12 | |
| purA regulation | (([swissprot-AllText:purA*] & [swissprot-AllText:regulation*]) | [swissprot-AllText:purA regulation*]) | 23 |
Файл с сохраненными последовательностями в fasta-формате.
Файл с теми же последовательностями, в котором указаны ID, AC, организм, название и длина белка.