Все семестры и проекты

Первый семестр

• Бактерия Veillonella parvula
• Белок YABJ_BACSU
• ACD ChemSketch
• Карты Рамачандрана
• Вторичная структура белка
• Rasmol
• Contacts

Второй семестр

• Описание программ
• Uniprot
• Поисковые системы
• Pubmed
• Выравнивание последовательностей
• Программы парного выравнивания
• Программа BLAST
• Множественные выравнимания
• Паттерны и профили
• Pfam и InterPro
• MEME и MAST
• PSI-BLAST

Третий семестр

• Химическое строение нуклеиновых кислот
• А- и В-формы ДНК. Структура РНК
• Комплексы ДНК-белок
• Банк данных EMBL
• Программы BLAST для работы с нуклеотидными последовательностями
• Программа getorf. Поиск некодирующих последовательностей
• Самостоятельная работа по предсказанию генов
• Геномные браузеры

Четвертый семестр

• Что такое филогенетическое дерево
• Реконструкции филогенетических деревьев
• Алгоритмы реконструкции деревьев
• Реконструкция деревьев по нуклеотидным последовательностям. Анализ деревьев, содержащих паралоги
• Классификация ферментов ЕС
• Криотская энциклопедия генов и геномов (KEGG)
• Функциональная роль гена в подсистеме, GO, SEED
• Особенности мембранных белков
• Эволюционные домены
• Эволюционные домены (2)
• Профили
• Анализ результатов поиска по профилю

Седьмой семестр

• Электронная плотность. Рассеяние на электроне