Описание бифункциональной дезацителазы и дегидротазы (bifunctional UDP-3-O-[3-hydroxymyristoyl] N-acetylglucosamine deacetylase and (3R)-hydroxymyristoyl-[acyl carrier protein] dehydratase) бактерии Flavobacterium branchiophilum

Вирус
Бактерия
Белок
Сравнение геномов
Главная страница
Информация о белке и его гене, приведена в таблице 1.


Свойство Значение
Код доступа записи RefSeq YP_004844729.1
Метка локуса FBFL15_2487
GI 347537304
GenelD 11153744
Начало в геноме 2921399
Конец в геноме 2920008
Цепь Обратная
Длина гена 1392
Длина белка 463
Описание белка Участвует в метаболизме липидов: переносит 3-гидроксимиристиновую кислоту с белкового носителя на 3-гидрокси-группу UDP-GlcNAc
Таблица 1.

Окружение гена белка lpxC/fabZ в геноме


Рисунок 1.Изображение гена lpxC/fabZ и соседних с ним lpxA и lpxD.


Все три гена лежат на обратной цепи ДНК.
Расстояние от lpxC/fabZ до lpxA 8 п.н. до lpxD -3 (то есть гены перекрываются на 3 нуклеотида).
Рамка считывания соседей относительно гена lpxC/fabZ равна +2.
Ближайший к гену lpxC/fabZ ген на комплементарной к его цепи ген (то есть на прямой цепи) лежит через 13 генов с 5` конца и через 6 – с 3` конца.
Вполне возможно, что эти три гена могут входят в один оперон, так как они лежат достачно близко друг к другу, кроме того, гены функционально связаны: они участвуют в переносе ацильной группы.

© Широковских Татьяна