Эволюционная модель

В нашей эволюционной модели мы мутировали исходный ген белка MetJ_ECOLI ,используя программу msbar пакета Emboss. Получили мутантные последовательности, соответствующие всем узлам дерева.

Начальные данные: нуклеотидная последовательность данного белка и правильная скобочная структура (на 100 нуклеотидов):

(A:90, (((B:25,C:25):10, D:35):5, (E:30, F:30):10):50);

Cкрипт, позволивший получить последовательности

msbar met_j a.fasta -point 4 -count 285 -auto
msbar met_j uzel1.fasta -point 4 -count 158 -auto
msbar uzel1.fasta uzel2.fasta -point 4 -count 16 -auto
msbar uzel2.fasta uzel3.fasta -point 4 -count 32 -auto
msbar uzel3.fasta b.fasta -point 4 -count 79 -auto
msbar uzel3.fasta c.fasta -point 4 -count 79 -auto
msbar uzel2.fasta d.fasta -point 4 -count 111 -auto
msbar uzel1.fasta uzel4.fasta -point 4 -count 32 -auto
msbar uzel4.fasta e.fasta -point 4 -count 95 -auto
msbar uzel4.fasta f.fasta -point 4 -count 95 -auto