Отчет по практикуму 2. Внутренности белков и макромолекулярных комплексов.
На этой странице выложен отчет по практикуму 2.
1.
Скрипт Core, показывающий изображение гидрофобного ядра одного белка на фоне остовной модели.
Скрипт Core2, показывающий изображение, позволяющее увидеть выходы гидрофобного ядра на поверхность белковой глобулы.
2.
Скрипт Density1 для задания 2a
Скрипт Density2 для задания 2b
Скрипт Density3 для задания 2c
Скрипт Density4 для задания 2d
Скрипт Density5 для задания 2e
Скрипт Density6 для задания 2f
Скрипт Density7 для задания 2g
Скрипт Density8 для задания 2h
Скрипт Density9 для задания 2i
1)Атомы, которые полностью покрывают поверхность остатка расположены на расстоянии 4 ангстрема.
2)Характерное расстояние между соседними атомами в белки, не соединенными ковалентной связью составляет 3,75 ангстрем.
3)Между соседнми атомами может не поместиться еще один, так как ван-дер-Ваальсов диаметр атома не менее 2,8 ангстрем(кислород), а с учетом радиусов атомов, составляющих не менее 2,8 ангстрем
атом межу соседними атомами поместиться не может.
3.
ДНК-белковый комплекс в формате pdb.
ДНК-белковый комплекс. Задания 3, 4.
Задание 5.
Это реакция проходит по механизму перициклического нуклеофильного замещения. Это реакция в ходе транскрипции при образовании аминоацил-тРНК.