| E. coli K12 | Shewanella frigidimarina (strain NCIMB 400) | |
|---|---|---|
| Идентификатор протеома | UP000000625 | UP000000684 |
| Число последовательностей | 4,313 | 3,990 |
| Число остатков | 1,351,622 | 1,345,936 |
Таблица 1. Общая информацция о протеомах S. frigidimarina (strain NCIMB 400) и E. coli K12
| Остаток | S. frigidimarina, % | E.coli, % | Разность процентов, % |
|---|---|---|---|
| L | 10.48 | 10.68 | 0.19 |
| A | 8.94 | 9.51 | 0.57 |
| G | 6.63 | 7.37 | 0.74 |
| V | 6.89 | 7.07 | 0.18 |
| I | 6.67 | 6.01 | 0.66 |
| S | 6.74 | 5.80 | 0.94 |
| E | 5.46 | 5.77 | 0.31 |
| R | 4.22 | 5.52 | 1.30 |
| T | 5.58 | 5.39 | 0.18 |
| D | 5.69 | 5.15 | 0.54 |
| Q | 4.99 | 4.44 | 0.55 |
| P | 3.86 | 4.43 | 0.57 |
| K | 5.07 | 4.41 | 0.67 |
| N | 4.48 | 3.94 | 0.55 |
| F | 4.07 | 3.89 | 0.18 |
| Y | 3.03 | 2.84 | 0.19 |
| M | 2.68 | 2.82 | 0.15 |
| H | 2.30 | 2.27 | 0.03 |
| W | 1.18 | 1.53 | 0.35 |
| C | 1.03 | 1.16 | 0.13 |
| U | 0.00 (встречается 0 раз) | 0.00 (встречается 3 раза) | 0.00 |
Согласно данным, приведенным в таблице 2, три наиболее часто встречающихся аминокислотных остатка в протеоме E. coli - лейцин, аланин и глицин, в протеоме S. frigidimarina - лейцин, аланин и валин. Тройка самых редко встречающихся аминокисот, за исключением селеноцистеина, для рассматриваемых протеомов совпадает. Наибольшая разница в процентном содержании в пользу S. frigidimarina наблюдается для аргинина (1.30%), в пользу E. coli - для серина (0.94%)