PWM для последовательности Шайна-Дальгарно в геноме бактерии Neisseria gonorrhoeae, штамм FA 1090

Для работы я скачала полную последовательность ДНК бактерии Neisseria gonorrhoeae, штамм FA 1090 из геномного бразуреза NCBI. По геномной таблице были выбраны координаты начала 100 генов, находящихся в середине генома, и посчитаны координаты последовательностей, предположительно включающих последовательности Шайн-Дальгарно (от -34 до 1 относительно координаты начала гена). Затем, с помощью программы seqret пакета Emboss были получены сами последовательности: seqret @list2.txt new2.fasta. После этого последовательности подали на вход программе ememe: ememe new2.fasta. Html-вариант выдачи показан по ссылке. Лого выравнивания показано на рис.1.

Рис.1. Logo