PROSITE - база данных мотивов аминокислотных последовательностей, она использует профили и паттерны.
PFAM - содержит домены, которые мы ищим по HMM-профилям.
InterPro - содержит белковые семейства, функциональные сайты, домены etc, является интегрированой, а также содержит ссылки на другие белки из семейства.
Доменная структура
Мотивы в аминокислотной последовательности
Данные InterPro
Деревья