На страницу 3D.html

Изображение гидрофобных кластеров белка NAGK.







РИС.1 Демонстрация гидрофобныx ядер (core1, 2, 3) или кластеров в белке NAGK
На картинке изображена молекула белка NAGK в петельной модели и в раскраске "по структуре". Красные петли: α–спирали, желтые петли: β–тяжи. Белые петли: бесструктурные элементы.
В шариковой модели представлены атомы гидрофобных ядер.
Синим выделено гидрофобное ядро (core3), расположенное между главным смешанным (преимущественно параллельным) β–листом и верхним слоем α–спиралей и β–шпильками;
Фиолетовым выделено гидрофобное ядро (core2), расположенное между главным смешанным (преимущественно параллельным) β–листом и верхним слоем α–спиралей;
Зеленым выделено гидрофобное ядро (core2), расположенное между главным смешанным (преимущественно параллельным) β–листом и нижним слоем α–спиралей;



Результаты получены с использованием алгоритма программы CluD (см. http://monkey.belozersky.msu.ru/Clud/cgi-bin/hftri.pl)







©Володя Рудько