|
РИС.1 Демонстрация гидрофобныx ядер (core1, 2, 3) или кластеров в белке NAGK
На картинке изображена молекула белка NAGK в петельной модели и в раскраске "по структуре". Красные петли: αспирали, желтые петли: βтяжи. Белые петли: бесструктурные элементы. В шариковой модели представлены атомы гидрофобных ядер. Синим выделено гидрофобное ядро (core3), расположенное между главным смешанным (преимущественно параллельным) βлистом и верхним слоем αспиралей и βшпильками; Фиолетовым выделено гидрофобное ядро (core2), расположенное между главным смешанным (преимущественно параллельным) βлистом и верхним слоем αспиралей; Зеленым выделено гидрофобное ядро (core2), расположенное между главным смешанным (преимущественно параллельным) βлистом и нижним слоем αспиралей; Результаты получены с использованием алгоритма программы CluD (см. http://monkey.belozersky.msu.ru/Clud/cgi-bin/hftri.pl) |