Укоренение в среднюю точку
Филогенетическое дерево, построенное по выравниванию белков IF2 (инициаторный фактор трансляции) бактерий из отедела Firmicutes методом Neighbor-Joining, было укоренено в среднюю точку с помощью программы retree пакета программ PHYLIP. Дерево изображено на рис. 1.
Дерево было укоренено в тривиальную ветвь:
{LACLM} vs {STRPN, ENTFA, CLOTE, STAES, BASCU, GEOKA}.
Укоренение данного дерева отличается от укоренения дерева, потроенного на основании таксономии:
{CLOTE} vs {STRPN, ENTFA,LACLM, STAES, BASCU, GEOKA}.
Следовательно, укоренение не верно.