На этот мы выровняли последовательности белка цитохрома B всех выбранных животных, чтобы построить филогенетические деревья при помощи программ Fastme и iqtree. Однако выяснилось, что у вида Elapsoidea semiannulata на NCBI есть только фрагмент нужного бека, поэтому я заменил его другим близким видом с полной последовательностью - Elapsoidea nigra. Создание деревьев программой Fastme проводилось с оценкой эволюционных расстояний моделями p-distance и MtREV. Укоренение деревьев производил при помощи аутогруппы - Zootoca vivipara
В результате можно заметить, что по топологии дерева все программы друг с другом согласны, но противоречат дереву Taxonomy. Программы считают, что таксон Henophida является парафилетическим(Рис.5, отмечено синим прямоугольником).
В такой ситуации сказать, что программы ошиблись было бы неправильным, ведь они все ошиблись одинаково. И к тому же, Henophida может быть традиционно вводимым парафилетическим таксоном.