Учебная страница курса биоинформатики,
год поступления 2023

Семестры Студенты Преподаватели

• 2024
• 2022
• 2021
• 2020
• 2019
• 2018
• 2017
• 2016

• ...

Семестр 4. Эволюция последовательностей

Расписание

Результаты Только для студентов и преподавателей

Записаться в очередь на проверку

Состояние очереди

Блок 1. Молекулярная филогения

1. Филогенетические деревья

7 февраля, С.А. Спирин, Д.В. Диброва

[ задание ] [ презентация [ДД] ] [ презентация [САС] ]

2. Алгоритмы филогенетической реконструкции

14 февраля, С.А. Спирин, Е. Рюмина

[ задание ] [ презентация [САС] ]

3. Алгоритмы (окончание). Укоренение. Сравнение деревьев. Бутстрэп

21 февраля, С.А. Спирин, Е. Рюмина

[ задание ] [ презентация [САС] ]

4. Семинар по практическим аспектам реконструкции филогении

28 февраля, Е. Рюмина, Д.Д. Диброва, Ю.А. Алёшина

[ задание ] [ Файлы для тренировки с iTOL ]

[ презентация ]

5. Коллоквиум

7 марта

[ программа ]

Блок 2. Функции белков

6. Базы данных KEGG и GO

14 марта, А.А. Жарикова, Ю.А. Алёшина

• [ задание ] [ презентация ]

7. Трансмембранные белки

21 марта, Д.В. Диброва, С.А. Спирин

• [ задание ] [ презентация ]

Блок 3. Сигналы и мотивы

8. Сигналы в геноме. Поиск известных сигналов

28 марта, А.В. Алексеевский, С.А. Спирин

[ задание ] [ пояснения ] [ презентация ]

9. Факторы транскрипции. Поиск de novo сигналов в ДНК

4 апреля, А.В. Алексеевский, С.А. Спирин

[ контрольная по PWM ] [ задание ] [ презентация ]

[ контрольная по Л8; откроем в 9:00 19 апр ] Правильные ответы закроют соответствующие темы коллоквиума

10. Мотивы в белках паттерны и PSSM для их поиска

11 апреля, А.В. Алексеевский, Р.А. Ириоглов

[ презентация pdf AAl ] [ презентация pptx РИ ] [ Mtase-classD ] [ Mtase-classB ]

[ выравнивание Mtase-classC для практического задания в классе ]

[ задание на дом ] [ пояснения ]

11. HMM-профили и эволюционные домены

18 апреля, С.А. Спирин, Р.А. Ириоглов

[ презентация ]

12. Коллоквиум

25 апреля

[ программа ]