Организм | Proteome ID | Число последовательностей | Число остатков |
Thermus thermophilus (strain HB27 / ATCC BAA-163 / DSM 7039) | UP000000592 | 2200 | 667609 |
Escherichia coli (strain K12) | UP000000625 | 4313 | 1351622 |
Название остатка | E.coli | T.thermophilus | Разность |
L | 10,68% | 14,60% | 3,93% |
A | 9,51% | 11,57% | 2,06% |
G | 7,37% | 9,32% | 1,95% |
V | 7,07% | 8,03% | 0,96% |
I | 6,01% | 2,59% | -3,42% |
S | 5,80% | 3,42% | -2,37% |
E | 5,77% | 8,59% | 2,82% |
R | 5,52% | 8,56% | 3,04% |
T | 5,39% | 3,74% | -1,65% |
D | 5,15% | 3,57% | -1,58% |
Q | 4,44% | 2,47% | -1,98% |
P | 4,43% | 6,57% | 2,14% |
K | 4,41% | 3,57% | -0,83% |
N | 3,94% | 1,55% | -2,39% |
F | 3,89% | 3,79% | -0,10% |
Y | 2,84% | 2,86% | 0,02% |
M | 2,82% | 1,54% | -1,29% |
H | 2,27% | 1,88% | -0,39% |
W | 1,53% | 1,37% | -0,16% |
C | 1,16% | 0,40% | -0,76% |
U | 0,00% | 0,00% | 0,00% |
Самым часто встречаемым остатком в обоих протеомах оказался лейцин (10,68-14,60%). Второе и третье место по популярности в протеоме
Thermus thermophilus занимают аланин (11,57%) и глицин (9,32%), так же, как и у Escherichia coli (аланин - 9,51%, глицин - 7,37%).
Реже всего у T.еhermophilus встречаются метионин(1,54%), триптофан (1,37%) и цистеин (0,40%). Для E.coli же наиболее редкими являются
гистидин (2,27%), триптофан (1,53%), цистеин (1,16%).
Самую большую разницу встречаемости можно наблюдать у аланина (3,93% в пользу T.еhermophilus) и изолейцина (-3,42% в пользу E.coli).
© Наумова Юлия, 2018