Описание белка клеточного деления FTSH

  

 

Запись белка в формате fasta 

>FTSH_ECOLI cell division protein FtsH

MAKNLILWLVIAVVLMSVFQSFGPSESNGRKVDYSTFLQEVNN DQVREARINGREINVTKKDSNRYTTYIPVQDPKLLDNLLTKNV KVVGEPPEEPSLLASIFISWFPMLLLIGVWIFFMRQMQGGGGK GAMSFGKSKARMLTEDQIKTTFADVAGCDEAKEEVAELVEYLR EPSRFQKLGGKIPKGVLMVGPPGTGKTLLAKAIAGEAKVPFFT ISGSDFVEMFVGVGASRVRDMFEQAKKAAPCIIFIDEIDAVGR QRGAGLGGGHDEREQTLNQMLVEMDGFEGNEGIIVIAATNRPD VLDPALLRPGRFDRQVVVGLPDVRGREQILKVHMRRVPLAPDI DAAIIARGTPGFSGADLANLVNEAALFAARGNKRVVSMVEFEK AKDKIMMGAERRSMVMTEAQKESTAYHEAGHAIIGRLVPEHDP VHKVTIIPRGRALGVTFFLPEGDAISASRQKLESQISTLYGGR LAEEIIYGPEHVSTGASNDIKVATNLARNMVTQWGFSEKLGPL LYAEEEGEVFLGRSVAKAKHMSDETARIIDQEVKALIERNYNR ARQLLTDFTNMDILHAMKDALMKYETIDAPQIDDLMARRDVRP PAGWEEPGASNNSGDNGSVDEPRTPNPGNTMSEQLGDK

Описания
1LV7
Первый код доступа
P0AAI3
Идентификатор последовательности в БД
FTSH_ECOLI
Название (краткое описание) белка
белкок клеточного деления FTSH
Дата последней аннотации
December 16, 2008
Название организма
Escherichia coli (strain K12)
Классификация организма (список таксонов)
Bacteria; Proteobacteria; Gammaproteobacteria; Enterobacteriales;
Enterobacteriaceae; Escherichia
Длина последовательности
644
Молекулярная масса белка
70,708
Число публикаций, использованных при создании документа
12
Журнал и год самой поздней публикации
Mol. Syst. Biol. 2:E1-E5(2006)
Описание вторичной структуры 

Цепь одна

Аминокислот 644

13-альфа спиралей

8-бета тяжей

1 поворот

Активный сайт - 415

Металл-связывающий сайт-414, 418

Ключевые слова
3D-structure; ATP-binding; Cell cycle; Cell division;  Cell inner membrane; Cell membrane; Complete proteome; Hydrolase;  Membrane; Metal-binding; Metalloprotease; Nucleotide-binding;  Protease; Transmembrane; Zinc.
Темы, освещённые в комментариях
Функции: Похож на АТФ зависимую цинк пептидазу, связанная с разрушением цитоплазмотических белков с С-конца. Этот белок вовлечен в механизм разрушения сигма-32.

Кофактор: связывается с цинком через подгруппы

Местонахождение: клеточная внутренняя мембрана

N-конец соответствует ААА АТФазному семейству

С-конец соответствует пептидазе М41

Идентификаторы записей PDB
1LV7

 

 

© Замараев Алексей