Эволюция доменной архитектуры
  1. Описание выбранного домена

AC: PF02171

ID: Piwi

Функция: гидролиз одноцепочечной РНК, направляемый двухцепочечной РНК.

Число разных доменных архитектур с этим доменом: 24

Число представителей по таксонам высшего порядка (царствам - если представлен в разных царствах): Eukariota - 237, Bacteria - 29, Archaea - 13

Ссылка на страницу домена в Pfam



  1. Выбор архитектур

502 последовательность с данной архитектурой

Второй домен в данной архитектуре - Paz (PF02170) с неизвестной функцией.

Для дальнейшей работы были выбраны 30 эукариотические последовательности с доменом Piwi длиной от 270 до 320 а.о.

378 последовательностeй с данной архитектурой

Для дальнейшей работы были выбраны 11 эукариотических, 14 бактериальных и 8 архейских последовательности с доменом Piwi длиной от 270 до 320 а.о.



  1. Выбор представителей

ссылка на выравнивание всех представителей

ссылка на выравнивание выбранных представителей

ссылка на таблицу



продолжение практики




© Eugenia Zotova