Скачать табличку с оценкой правдоподобия
Поиск мотивов в геноме коронавируса
В качестве вируса был выбран Severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 isolate 2019-nCoV_HKU-SZ-002a_2020
Таблица областей перед генами.
Координаты | Ген |
1-233 | orf1ab |
21430-21530 | S |
25260-25360 | ORF3 |
26112-26212 | E |
26390-26490 | M |
27069-27169 | ORF6 |
27262-27361 | ORF7 |
27761-27861 | ORF8 |
28141-28241 | N |
Результаты поиска мотива
Для дальнейшей работы был выбран первый мотив: он с низким e-value и встречается у 8 генов из 9.
Лого для мотива