Зачётное задание по блоку 3

Задание состоит в оформлении результатов практикумов и представлении их на своём веб-сайте. Сроки выполнения:
   – для группы 101: вечер 21 декабря;
   – для группы 102: вечер 17 декабря.

Вы должны создать следующие веб-страницы (в нижеследующем списке жирным шрифтом выделено заглавие (<H1>), которое должна иметь страница; тот же текст должна иметь гиперссылка с главной страницы первого семестра):

  1. Состав записи 0XXX банка PDB. Здесь должна присутствовать информация о составе записи ( домашнее задание к практикуму 11); страничка должна быть в формате HTML! Ниже — краткое описание одной из цепей белка: изображения цепи в остовной модели (результаты задания 4 практикума 11 и задания 2 практикума 13), характеристика вторичной структуры (какого типа белок, сколько в данной цепи альфа-спиралей и бета-тяжей).
  2. (*) (необязательный пункт; название придумайте сами) — описание общей формы белка, оценка его абсолютных и относительных размеров (задание 4 практикума 12); желательна картинка.
  3. Контакты название лиганда с белком таким-то по данным записи 0XXX — результаты задания 1 практикума 13, то есть список остатков, контактирующих с лигандом и изображение контактов одного из этих остатков. То и другое должно иметь надлежащие заголовки.
  4. Элемент вторичной структуры белка такого-то — результаты задания 1 практикума 14 (включая формулировку правила, описывающего "паттерн" водородных связей между остовными атомами элемента).
  5. (*) Контакты альфа-спирали такой-то (или бета-тяжей таких-то) с остальной структурой (необязательный пункт) — результаты задания 4 практикума 13.
  6. Торсионные углы. На этой страничке должны присутствовать (с разумными пояснениями) полученные вами точечные диаграммы торсионных углов φ и ψ (задание 2 практикума 14).
Все картинки и таблицы должны иметь заголовки либо подписи!

Каждая страница должна быть "самодостаточна", то есть понятна постороннему человеку без обращения к тексту заданий. Гиперссылки со страницы первого семестра должны быть разумно организованы (правильно будет создать из ссылок на новые страницы ненумерованный список под общим заголовком "Структура белка такого-то"). Нумеровать страницы не надо: приведённая нумерация — исключительно для лучшего понимания. Задания, обозначенные звёздочкой (*) — дополнительные (на зачёт не влияют, но влияют на рейтинг).

По вашему сайту будут оцениваться:
   А) правильность полученных результатов;
   Б) наглядность представления результатов.
Кроме того, по вашим рабочим директориям будут оцениваться:
   Г) скрипты, которые вы составляли на практикумах;
   Д) порядок в директориях.

Имеет смысл за пару дней до зачёта проверить состояние рабочих директорий.

Сроки зачётов

Зачёт по третьему блоку будет приниматься:
   – у группы 101 22 декабря (понедельник) с 15:35 до 17:20
   – у группы 102 19 декабря (пятница) с 9:00 до 10:35
На зачёте никаких добавочных заданий не будет, а будут проверяться результаты и оформление обязательных заданий. Тем, у кого будет обнаружены те или иные недочёты, будет предоставлена возможность их исправить.

Долги по всем блокам будут приниматься у обеих групп 22 декабря с 17:20 до 20:00 и (только у тех, у кого долгов останется мало) 25 декабря с 10:55 до 13:00.

Те, кто не отчитается по всем обязательным заданиям к 13:00 25 декабря, будут вызваны 29 или 30 декабря на специальную комиссию и с высокой вероятностью останутся без зачёта (со всеми вытекающими грустными последствиями).