Kodomo

Пользователь

Учебная страница курса биоинформатики,
год поступления 2020

Полезные ссылки

Ведомость

Правила

Язык R

RStudio

RStudio на kodomo

cheatsheets

Пропуски занятий - если вы попустили занятие по уважительной причине, запишитесь в форму для пересчета баллов. Медицинские справки регистрируйте в учебной части.

Данные для проекта - необходимо запросить датасет или предложить свой. Все датасеты должны быть утверждены преподавателем. Если вам не понравился датасет, вы не можете придумать, как его проанализировать - можно запросить или предложить другой датасет неограниченное количество раз до 22 декабря. Можно брать не все данные, если их очень много; выберите случайно или по какому-либо признаку необходимое количество данных, не забудьте рассказать об этом.

Занятия

1. 2.09.2022. Введение в R, RStudio, вектор (Жарикова А.)

Презентация

[QuizHW1] - подготовить к занятию №2

[HW1] - дедлайн 20.09.2022 (23:59)

2. 9.09.2022. Вектора, срезы, таблицы, матрицы (Жарикова А.)

Презентация

Quiz1.1

Quiz1.2

[QuizHW2] - подготовить к занятию №3

[HW2] - дедлайн 27.09.2022 (23:59)

3. 16.09.2022. Списки, циклы. Установка пакетов. dplyr, stringr (Жарикова А.)

Презентация

Quiz2.1

Quiz2.2

[QuizHW3] - подготовить к занятию №4

HW3 - дедлайн 14 октября (11:00)

4. 23.09.2022. forcats, ggplot2 (Валяева А.)

Презентация

пингвинчики

Quiz3.1

Quiz3.2

[QuizHW4] - подготовить к занятию №5

HW4 - дедлайн 10.10.2022 (23:59)

5. 30.09.2022. ggplot2, "длинный" и "широкий" форматы данных, функции, dplyr (Валяева А.А.)

Презентация

Quiz 4.1

Quiz 4.2

[QuizHW5] - подготовить к занятию №6

HW5 - дедлайн 18.10.2022 (23:59)

6. 7.10.2022. Функции, работа с ошибками, работа с цветом на графиках, теплокарты (Валяева А.А., Жарикова А.А.)

Презентация

Quiz 5.1

Quiz 5.2

HW6 - дедлайн 24.10.2022 (23:59)

7. 14.10.2022. Контрольная работа

Контрольная 1, группа 1

Контрольная 1, группа 2

8. 21.10.2022. Концепция P-value. Взаимодействие двух переменных. z-test. t-test. chi-square contingency test. Корреляция.

9. 28.10.2022. Практическая работа по анализу взаимодействия двух переменных

10. 11.11.2022. Линейная регрессия. ANOVA. Проблема множественного тестирования

11. 18.11.2022. Практическая работа по линейной регрессии, ANOVA и проблеме множественного тестирования

12. 25.11.2022. Проверка гипотез о распределении одной переменной. ks-test. хи-квадрат тест goodnes of fit. PCA. tSNE. UMAP

13. 02.12.2022. Практическая работа по проверке гипотез о распределении одной переменной, PCA, tSNE, UMAP

14. 09.12.2022. Анализ дифференциальной экспрессии (А.А. Валяева)

Презентация

15. 06.12.2022. Визуализация результатов (А.А. Жарикова)

Презентация

2020/5 (последним исправлял пользователь anastaisha_w 2022-12-16 14:13:11)