Kodomo

Пользователь

Pseudomonas fluorescens F113 review

Here You can find some links:

Review itself Over here

Excel file used while analyzing data Here

And an Excel file with unused features and this type of data Here

Folder with the script and name data, which was used while analyzing genome data Is over here

Introduction

Pseudomonas fluorescens F113 – аэробная, Грам-отрицательная почвенная бактерия, способная к денитрификации,

относится к ризобактериям, то есть может вступать в симбиоз с высшими растениями.

Изначально была выделена из ризосферы сахарной свёклы.

Бактерия вызвала исследовательский интерес из-за способности ингибировать рост различных бактерий, грибов и нематод, патогенных для растений.

Данный штамм часто изучается как пример генетической регуляции образования вторичных метаболитов, например антибиотиков макролидов.

Своё видовое название бактерия получила из-за секреции водорастворимого флуоресцентного пигмента пиовердина.

У этого штамма 1 хромосомная ДНК и размер генома приблизительно 6,9 миллионов bp. (данные о геноме взяты с базы NCBI)