Условия зачёта по практической биоинформатике
Школа бионформатики, осень 2016
Вариант 1.
К 10 декабря прислать мне протоколы выполнения всех заданий вместе с сопровождающими файлами.
Вариант 2.
Провести компьютерное исследование на основе публично доступных данных, описать его в стиле, близком к принятому в научных статьях, и прислать к 10 декабря мне вместе с сопровождающими материалами.
Исследование должно продемонстировать вледение следующими методами:
- поиск по аннотации в банках данных;
- поиск по сходству в банках последовательностей (или геномах или протеомах);
- создание множественного выравнивания биологических последовательностей и его исследование в Jalview или другом редакторе выравниваний;
- филогенетический анализ набора гомологичных последовательностей;
- работа с EMBOSS;
(желательно) работа с банками семейств белков (например, Pfam, PROSITE и/или InterPro).
С.А.Спирин sas@belozersky.msu.ru