Практическая биоинформатика ШАД (весна 2014, биологи I курс)

Здесь будут появляться задания, презентации и другая информация по курсу практической биоинформатики для студентов I курса ШАД.

Преподаватель: Сергей Александрович Спирин sas@fbb.msu.ru

Что нужно сделать ко второму занятию

• Установить на свой компьютер следующие программы:

  Обязательно: mEMBOSS (Windows) или EMBOSS (Linux, Mac).

  Желательно: PHYLIP (http://evolution.genetics.washington.edu/phylip/), Jalview, Jmol, Far manager (под Windows).

• Найти в Swiss-Prot по белку с известной вам функцией из человека, дрожжей и E. coli. Для каждого сохранить на своём компьютере файл с полной записью и файл с последовательностью в формате fasta. Определить для каждого идентификатор какой-нибудь записи EMBL с геном этого белка. Сохранить на своём компьютере файл с этой записью EMBL и файл в формате fasta с последовательностью гена белка.