Прежняя инструкция по установке Jalviw
* Как установить Jalview на своем компьютере:.... Скачиваете нужный инсталлятор с http://www.jalview.org/Web_Installers/install.htm и запускаете его.
Как установить Jalview под Windows 10:
Почему-то обычный инсталлятор для Windows под Windows 10 не срабатывает (пока?). Можно поступить так:
- Установить Java и убедиться, что выполнение команды java в командной строке WIndows выдаёт список опций (а не сообщение о том, что такой программы нет).
- Создать на своём компьютере директорию C:\Programs и в ней поддиректорию Jalview.
Скачать файл http://www.jalview.org/Web_Installers/InstData/Java/install-jalview.jar
Активизировать директорию с этим файлом в cmd, PowerShell или Far Manager и выполнить (в командной строке) команду java -jar install-jalview.jar. Должен запуститься установщик, который, в частности, спросит о директории, в которую поместить программу, укажите C:\Programs\Jalview. После окончания работы установщика убедитесь, что в этой директории появились многочисленные файлы, в том числе директория lib и файл jalview.jar
Создайте (лучше в редакторе Far Manager) файл Jalview.bat, содержащий единственную строку:
java -Djava.ext.dirs=C:/Programs/Jalview/lib -jar C:/Programs/Jalview/jalview.jar
Файл поместите на Desktop (то есть в директорию C:\Users\<username>\Desktop , где <usersname> — ваш логин). На вашем рабочем столе должна появиться иконка Jalview или Jalview.bat, щелчок по которой вызывает Jalview (на чёрное окно с большим кол-вом букв можно не обращать внимания).
Совет: при первом запуске Jalview зайдите в меню Tools → Preferences и уберите галочку из чекбокса "Open file" (чтобы при следующих запусках не возникали многочисленные окна с демонстрацией замечательных возможностей программы).
Как открыть Jalview через web:....
http://www.jalview.org/examples/applets.html => Start with Java web start
Предупреждение: В applet версии отсутствует меню "Web services". Кроме того, она блокируется большинством современных браузеров
