Работа с последовательностями и выравниваниями в питоне

План

• ... план был чистый термояд! ...

Ссылки

• Biopython:

  • Biopython cookbook (html), (pdf)

    • Chapter 3, sequences (тело последовательности)

    • Chapter 4, sequence records (последовательность с метаданными)

    • Chapter 5, sequence io

    • Chapter 6, Multiple alignments

• allpy:
  • ...

  • Примеры

  • Автогенерённая документация по исходникам

Контрольная работа

0. Имя:

1. Напишите плугин pyMol, который определяет команду fair_del, которая получает на вход выделение, удаляет все остатки, принадлежащие этому выделению, и перенумеровывает оставшиеся остатки соответствующим образом. Руководство по pyMol даёт невнятное объяснение, зачем, но настоятельно требует после подобных команд вызывать sort на изменённые атомы. fair_del должна это делать.