Kodomo

Пользователь

Практикум по биоинформатике для студентов каф. вирусологии

Февраль 2014 г.

Проводят:

Евгений Алексеевич Аксянов (evaksianov@gmail.com)

Сергей Александрович Спирин (sas@belozersky.msu.ru)

Андрей Владимирович Алексеевский (aba@belozersky.msu.ru)

Результаты


Программа

Обязательные задания по каждой теме

[Зачётное задание]   [Последовательности]

Темы 1 и 2. БД последовательностей и поиск по ключевым словам. SRS

11 февр. 2014, вторник, 11:00

Коды и названия канонических аминокислот

[презентация (DBs)]   [презентация (SRS)]   [Задания]   [Указания]  

Темы 3 и 4. Выравнивание. Молекулярная филогения. Поиск по сходству: BLAST

13 февр. 2014, четверг, 15:00

[презентация (выравнивания)]  [Задания]   [Q8V603.fasta]

Темы 5-6. Пространственные структуры. PDB. PyMol. PDBeFold.

20 февр. 2014, четверг, 15:00

[Задания]   [Презентация по PyMol]   [FAQ по PyMol]

[Презентация по Jmol]   [FAQ по Jmol]

Скрипты и примеры

[dna.pml] [EXAMPLE.PDB]