Задание
Не удержался, и тоже придумал задание, т.к. самому интересно :) ААл
На основе последовательностей митохондриальной ДНК вычислите расстояние (в числе мутаций) между
- двумя людьми
- двумя неандертальцами
- человеком и неандертальцем
- человеком и денисовцем (вид/подвид вымерших людей из Денисовой пещеры на Алтае)
- неандертальцем и денисовцем
По этим данным постройте филогенетическое дерево всех пяти последовательностей.
Идентификаторы записей с последовательностями:
Человек 1 |
FJ986465 |
Человек 2 |
GU170815 |
Неандерталец 1 |
NC_011137 |
Неандерталец 2 |
KC879692 |
Денисовец |
NC_013993 |
Используйте сервис из указаний к заданиям по лекции 2.
В данном случае карта мало информативна.
При каждом сравнении выпишите число (не процент) замен и число "гэпов" - вставок/делеций, они указаны перед выравниванием.