Вопросы по теме «Эволюция. Белки. Выравнивание последовательностей.»
- Что такое мутация? Какие бывают мутации?
- Как мутация ДНК может повлиять на белки, синтезируемые в данном организме (какие есть варианты)?
- Как происходит закрепление мутации?
- Что такое положительный отбор и отрицательный отбор?
- Что такое выравнивание биологических последовательностей?
- Как принято считать вес глобального и локального выравнивания?
- Что такое матрица сопоставления аминокислотных остатков?
- Что такое ортолог и паралог?
Вопросы по теме «Геномы»
- Что такое геном?
- Как устроена ДНК?
- Типичные размеры геномов различных организмов
- Структура генома (что такое ген; что, кроме генов, есть в геномах)
- Организация генома человека (хромосомы, отличия между мужчинами и женщинами)
- Степень различия геномов человека, шимпанзе и мыши
- Полиморфизмы. Степень различия геномов двух человек.
Вопросы по теме «Секвенирование и сборка геномов»
- Приборы для секвенирования: с каким материалом работают и какие данные получаются в результате работы.
- Задача картирования на известный геном: когда возникает, какие основные проблемы встают.
- Задача сборки de novo: когда возникает, какие основные проблемы встают, на каких принципах основаны алгоритмы.
- Результат работы программы сборки и показатели её качества.
- Что такое контиг?
- Перечислите известные Вам приложения секвенирования.
Вопросы по теме «Пространственная структура макромолекул»
- Способы визуализации пространственных структур
- Структура ДНК и РНК
- Структура белка. Внутримолекулярные взаимодействия, способствующие укладке белковой цепи.
- Глобулярные, фибриллярные и мембранные белки.
Вопросы по теме «Биоинформатика и разработка лекарств»
- Основные методы, используемые при компьютерной разработке лекарств.
- Молекулярный докинг. Виртуальный скрининг библиотек химических соединений.
- Библиотеки химических соединений. Фильтрование соединений по свойствам. «Правило пяти» Лепински.
- Методы конструирования лигандов «de novo».
Вопросы по теме «РНК»
- Перечислите 10 функций РНК
- Что такое вторичная структура РНК?
- Что такое шпилька?
- Что такое эволюционно-консервативная структура РНК?