21 февраля
Первые впечатления при проверке первого полученною мною выполненного задания по лекции 1
ААл
- Как и ожидалось, самое тривиальное задание 0 выполнено неверно! И это у биотехнолога 2го курса!!!
Прочитайте в презентации в каком порядке всегда записывается последовательность ДНК в банках данных: от 5' к 3' или от 3' к 5' концам!
Очень мало комментариев, личных впечатлений, выводов о том, что вы узнали нового, выполнив задание? Я вот узнал при проверке и удивился, что секвенирован геном бледной поганки! Зачем? Почему? Где? Мне это интересно! В работе не написано ничего - даже того, что это геном бледной поганки. Студент написал латинское название вида, мне пришлось самому искать что это за вид такой
В задании 2 следовало указать ссылки на источник. Например, у кого самый большой геном. Когда я придумывал этот вопрос я знал ответ - но это было лет пять или даже более лет тому назад. А в эпоху революции в технологии секенирования за пять лет все устаревает. Мне не хочется повторять изучение этого вопроса, это требует времени. Поэтому студенту правильно было бы привести ссылку на источник информации. Теперь мне остается надеяться на ответы других студентов, сравнить их и выбрать правильный
27 февраля
Дополнения по результатам проверки заданий по лекции 1.
Задание 1. Строите карту, пишите "видна делеция в одном геноме". В каком геноме и в каком месте? Отдельные студенты обводят кружочком нужное место на карте. Это хороший способ.
Можно и без графики - указать в каком месте - ведь оси карты имеют кооординаты - номера нуклеотидов, пусть и с небольшой точностью. Укажите номера нуклеотидов, хотя бы приблизительно! (Точный номер тоже указан в выдаче, в той части, в которой показаны выравнивания похожих участков геномов)
Я не сказал и не написал важную информацию про геномы бактерий. Как правило, у бактерий - кольцевые ДНК! (Исключения бывают.) Для включания в базу данных кольцевую последовательность разрывают и хронят линейную последовательность, но в заголовке записи из банка данных указывается, что ДНК кольцевая. А что будет на карте,если у родственных штаммов разорвали последовальность вразных местах???
ААл