Содержимое страницы «Main/mf_2023s/tasks9/variant».

[ PPD-Prokaryotic Promoter Database[1] ]

[1] Su et al., PPD: A Manually Curated Database for Experimentally Verified Prokaryotic Promoters. J Mol Biol. 2021/

Пока такие варианты.

Вариант 1. Промоторы 7 генов белков Burkholderia cenocepacia J2315 из базы данных PDD

>104/6-51

GGGTCACGATGCCCGATTCGTGATCGACGTCAATCACCCGGGTATA

>58/1-51

TTTATCCGTCACCCGAAAATTCATCGAAAAGGTAAAGCATTGCAATATAAC

>113/1-51

GCGACTGCACTTCTCGATCGACGAAGTCCCGACCCTGCAGAAGCTCGATAA

>227/1-51

CGATTTCATCGAAATCCTTTGGACCATCGATTTTCTGCAAATAGCGACCAA

>180/1-51

CCCGTATGGGTCGTGATGGCGCGATGTCGCACCTGCATCGAAAGGCGATAC

>250/1-51

ATGAGTCGGCTAAAAATATTAATTGGTCGCATTTTCCGGATCGACGCTAAC

>261/1-51

CGATGTAGTCGTCCAAACAGTTTTGCGTGATCGATATGATTAAATCTGTAC

Вариант 2. Промоторы 7 генов белков Burkholderia cenocepacia J2315 из базы данных PDD

>261/11-70

GTCCAAACAGTTTTGCGTGATCGATATGATTAAATCTGTATAGTGGCTTTACCCCATACT

>220/15-56

CGGGCGCGTGCACTGCAGCATCGAACGATTGGTGGCACACTA

>30/18-77

AAAGCTGAAGGCTTTCGCTGAGTACATCCTAGAAAACGTTCATCGAAATGAAAAGTTGAC

>96/16-75

GCGGTTGCCGTCCGTTCGGAGAGATAGTTGGCATAGGATCGAGAGATCGCCGTCGCTCGC

>13/11-70

CCGGGAAGCCATACTCGCCGAAGCCCTTGATTTGCGCGAAGATCGACTCGGCGAACTCGC

>26/11-55

TTGATCGCGGCTTCTAGGTCGTGGATCGAAATATCGGACATGATT

>127/34-81

ACGGACGTAAAGAGACTATTGTCAGACAAGGGAACCTCCTCCATCGAC

Вариант 3. Промоторы 7 генов белков Burkholderia cenocepacia J2315 из базы данных PDD

>>36/31-81

GCCGTCCCGCGTACCGGTATACTTCCACTCCTGCCTTGTCCGGCATCGAGG

>>127/31-81

ATCACGGACGTAAAGAGACTATTGTCAGACAAGGGAACCTCCTCCATCGAC

>>13/13-64

GGGAAGCCATACTCGCCGAAGCCCTTGATTTGCGCGAAGATCGACTCGGCGA

>>30/26-77

AAGGCTTTCGCTGAGTACATCCTAGAAAACGTTCATCGAAATGAAAAGTTGA

>>134/5-56

CGGGACCAGCGCATTCCAACCGGCGCTGGGCCGGCCGCGATCGACATGCCCC

>>193/31-81

CGCCAAAAGGGCTTCCGCTATGCTGGCGCGATCGAATCGACACTGAAAACG

>>228/18-69

GGCCGATGCGCGGCACGCGGCGTGCGCGGGTAACATCGAAACCGATGCGCCC