МФК "Биоинформатика", весна 2026

Задания по лекции 6

Для выполнения задания заполните форму, используя полученную в заданиях информацию. Настоятельно рекомендую не только отправить данные в форме, но и вести файл-протокол своих действий и сохранить полученные данные, чтобы иметь возможность исправить допущенные ошибки.

Задание 1. Получите информацию о выданном белке в UniProt

1. Найдите в таблице идентификатор UniProt выданного Вам белка.

2. Найдите запись выданного белка в базе данных UniProt.

3. Выпишите название белка (поле DE).

4. Выпишите длину выданного белка (в аминокислотных остатках).

5. Выпишите, к какому организму относится данный белок.

6. Выпишите, к какому из доменов жизни относится данный организм.

Задание 2. Найдите этот же белок по названию у архей (Archaea) и эукариот (Eukaryota)

1. В UniProt выберите режим поиска Advanced, ищите по базе данных UniProtKB (стоит по умолчанию).

2. Задайте поиск одновременно по двум полям:

   • Ищите по полю "Protein Name [DE]" название выданного белка;

   • Ищите по полю "Taxonomy [OC]" название домена (Archaea или Eukaryota).

3. Из найденных белков в каждом домене выберите какой-то один и выпишите для него все те же параметры, что и в задании 1 (таким образом, всего нужно получить данные для двух белков - один белок из архей, один белок из эукариот).

4. Для каждого из выбранных белков обоснуйте, что нашли тот же белок, что и выданный Вам (можно использовать разные дополнительные данные из записи UniProt).

Задание 3. Сделайте выводы

1. На основании результатов поиска предположите, мог ли выданный Вам белок присутствовать уже у LUCA на основании полученных Вами данных? Ответ обоснуйте.