Практикум 8
Гистограмма
В таблице Practice 8 на листе CDS расположены данные по кодирующим белки ДНК последовательностям бактерии Clostridium felsineum DSM 794. На листе Histogram я строила гистограмму распределения длин белков этой бактерии. В колонке length я обозначила карманы с шагом в 45 аминокислот (последние три кармана я сделала больше, так как оставлять их настолько маленькими не имеет смысла). В следующей колонке protein length я с помощью содержимого колонки length создала подписи в виде диапазонов для будущей гистограммы. В колонке count я посчитала количество белков с длиной, попадающей в соответствующий диапазон. Затем я преобразовала колонки protein length и count в гистограмму.
Задание 3
Описательная статистика
В таблице Practice 8 на листе Statistics в колонке mean length я посчитала среднюю длину всех белков с листа CDS, в колонке standard deviation - стандартное отклонение длин белков, в колонке median - медиану длин белков, в колонке min length - минимальную длину белков на листе CDS, в колонке max length - максимальную длину белков на листе CDS.
Оценка степени случайности различия двух чисел
На листе Significance в первых 5 строчках я вывела для трех хромосом бактерии Clostridium felsineum DSM 794 количество CDS на + и - цепях и посчитала для них статистическую значимость. В результате этого я могу сказать, что на обеих цепях главной хромосомы бактерии расположено приблизительно равное количество CDS, так как статистическая значимость равна 95,2%. На плазмиде p337 расположено меньше CDS, поэтому, несмотря на не очень сильную разницу в количестве CDS на обеих цепях, статистическая значимость равна 9,4%. На плазмиде p19 еще меньше генов, поэтому для нее проводить оценку степени случайности бессмысленно, что показывает получившееся значение, которое равно 0,0076%.
Функция VLOOKUP
В колонке accession на листе VLOOKUP я поместила несколько случайно выбранных ячеек из колонки product_accession на листе CDS. С помощью функции VLOOKUP в колонке name на листе VLOOKUP я вывела соответствующие ячейкам в колонке accession названия из таблицы на листе CDS. При записи в колонку accession текста или несуществующей в колонке product_accession на листе CDS ячейки и продлении функции VLOOKUP вниз будет выдаваться ошибка.