Практикум 4

Задание 1.

1. Заходим на kodomo по ssh. из папки копируем файл со своим пользовательским именем .Потом копируем в credits.

2. затем заходим на кодомо по sftp, дальше get <имя файла>.

3. На картинке обезьяноподобный предок человека.

Задание 2. Фото из старшей школы.

Задание 3.

• переходим по cd /P/y20/term1/pr4/files

с помощью команды ls | wc (результат 88 88 1132) узнаем количество файлов директории 88

с помощью команды echo *.txt | wc 1 14 165 узнаем количество файлов директории заканчивающихся на .txt 14

c помощью команды cat 1.fasta Xax229_230.fasta pan1_mouse.fasta pan3_mouse.fasta >Xxxx_all.fasta (сначала копируем эти файлы в pr4,после команды копируем в credits).

Задание 4.

• c помощью команды grep '^>' Ivan.yankovich_all.fasta > Ivan.yankovich_all.names в P4 создаем фаил и копируем его в credits.

• c помощью команды grep '^>' -c *.fasta узнаем сколько в фаиле строк начинается на ">".

1.fasta 1

Xax229_230.fasta 2

• pan1_mouse.fasta 1

pan3_mouse.fasta 1

Доп. задание:

• переходим в нужную директорию и c помощью команды echo *.pdb 1DLP.pdb 1GT0.pdb 1KMY.pdb 1MNM.pdb 2B5A.pdb 5RXN.pdb 7GPB.pdb видим фаилы заканчивающиеся на .pdb

Выбранный файл: 1KMY.pdb

c помощью команды grep '^ATOM' 1KMY.pdb| grep 'HIS' -c считаем количество атомов гистидина

Количество атомов гистидина в структуре белка: 100.