Практикум 4

Задание 1

С помощью FTP - клиента FileZilla, я подключился к kodomo, перешел в нужную директорию и скачал файл "jakewayd", в нем был изображен, насколько я понял, Юрский период: динозаврики, большие травинки и тд

Задание 2

На той фотографии был интересный день моей жизни:

Я узнал, что прошел отборочный этап на олимпиаду "Покори Воробьевы горы", и нужно было отправить заявку на регистрацию на очный этап. Именна эта фотография и попала на регистрационный лист.

Задание 3

По адрессу /P/y20/term1/pr4/files расположены 91 файл. Сначала я попробовал использовать команду ls | wc -l получил, что в каталоге 88 файлов. Однако, когда я себя проверял с FileZilla, увидел, что файлов 91. Сначала я не понял в чем дело, но, изучив опции команды ls, обнаружил опцию -A, которая подсчитывает все файлы, включая скрытые файлы (скрытые - это файлы вида '.*.*'). В результате я получил 91 файл командой ls -A | wc -l .

Я получил от команды ls -A *.txt | wc -l ответ, что в каталоге 14 файлов формата txt.

После того как я ввел команду cat *.fasta > ~/term1/block1/credits/Gukov_all.fasta . Эта команда находит все файлы .fasta , а, впоследствии, создает файл, в котором объединены все найденные .fasta .

Задание 4

Я ввел команду grep '>' Gukov_all.fasta > Gukov_all.names , и получил новый файл. Также немного другой командой

В директории /P/y20/term1/pr4/files ввел команду grep '>' *.fasta

1.fasta:>3VMF_A

Xax229_230.fasta:>Xax230 AE011974.1_6228-6563 -1

Xax229_230.fasta:>Xca229 AM039952.1_1235003-1235335 1

pan1_mouse.fasta:>PAN1_MOUSE

pan3_mouse.fasta:>PAN3_MOUSE

Этот выход означает, что в каждом файле, кроме Xax229_230 (тут два '>'), по одному '>'

Также я смог найти количество атомов гистидина в структуре белка, описанной в файле 1DLP.pdb, с помощью команды grep 'ATOM' 1DLP.pdb | grep 'HIS' -c , я смог узнать, что их 300.