Описание команды comm

Для чего применяется команда comm?

comm - compare two sorted files line by line

Команда comm применяется в случаях, когда необходимо сравнить два файла, то есть найти в них одинаковые и отличающиеся элементы. С ее помощью comm можно сравнить белки, синтезируемые двумя какими-нибудь бактериями, и, например, найти одинаковые.

Как использовать comm?

В использовании comm есть несколько критериев, которые необходимо учесть перед началом использования команды. Они указаны даже в расшифровке названия команды (выделила курсивом). Во-первых, comm способен сравнивать только отсортированные по алфавиту файлы, а во-вторых, сравнение их содержимого производится построчно. Это означает, что прежде чем сравнивать файлы с помощью comm, их содержимое нужно упорядочить в строки по алфавиту.

Синтаксис comm: comm [option1] [option2]... file1 file2

где [option] - необходимая опция; file1 и file2 - сравниваемые файлы

Без использования какой-либо опции команда comm выводит на экран 3 колонки. В первой находятся строки, уникальные для file1, во второй - строки, уникальные для file2, в третьей - строки, общие для file1 и file2.

Пример1:

$ comm file1 file2

AAA 
       AUG
              GGU
       GUC
UAU

Опции comm

comm --nocheck-order

Опция --nocheck-order не проверяет корректность сортировки файлов и сравнивает их в введенном виде построчно. В таком виде использования comm важно не только наличие строки, но и её место в файле.

• Пример2:

$ comm --nocheck-order file1 file2

Выход программы

                GGU
AUC
AAA
        AUG
        GUC

comm --total

Опция --total позволяет подсчитать количество элементов в каждом столбце. На выходе будут получаться все те же три столбца, только к ним добавится еще одна строка в конце: это количество элементов в каждом из них.

Так, для Примера1, опция --total выведет под столбцами следующие значения:

$ comm --total file1 file2

AAA
       AUG
               GGU
       GUC
UAU
 2      2       1    total