Практикум 1, задание 5

• Ген - S;
• Координата первого нуклеотида в старт-кодоне: 21563;
• Координата третьего нуклеотида в стоп-кодоне TAA: 25384;

Решение:

1. Поиск RNNATG (последовательности Козак и старт-кодона) на [21500:21700]. Ближайший ATG к примерному началу гена имеет номер первого нуклеотида 21563≡2(mod3);
2. Поиск TRR на [25300:25500]. Первый не-TGG кодон с номером первого нуклеотида, сравнимым с 2 по модулю 3, является кодоном ТАА и имеет номер последнего нуклеотида 25384.