|
|
|
|
Бактерия Methanopyrus kandleri.
Метаногены (Methanogens) — это археи, которые образуют метан как побочный продукт метаболизма в бескислородных условиях.Methanopyrus kandleri - третий упорядоченный экстремофил, которого обнаружили в в гидротермах океана рядом с "Черными курильщиками" (принципиально новые экосистемы в глубинах океана, открытые в конце 1970х годов, которые используют вместо фотосинтеза р-ии окисления неорганических веществ). Черные курильщики - гидротермальные источники с большой концентрацией пирита, который, осаждаясь, образует в толще воды клубы черной взвеси. Основа экосистемы - прокариоты-хемосинтетики, большинство из них так же термофилы (оптимальная температура роста - 60-80 С), и даже гипертермофилы (выше 80 С). Вот почему интересно, каким образом эти организмы преобрели в ходе эволюции столь необычные свойства. Был ли процесс приспособленья похож на случайное блуждание в поисках благоприятных мутаций, или двигался более рациональным путем, затрагивая прежде всего определенные физиологические системы клеток? Найти ответ на эти вопросы должны помочь геномные данные.
Расшифровав полный геном Methanopyrus kandleri, оказалось что у нее есть относительно немного генов, переданных от других организмов по сравнению с другими археями. Вероятно, это произошло из-за чрезвычайной окружающей среды, которая ограничила ее способность обмениваться генами с другмим организмами.
Таксономия:
Domain: Archaea
Kingdom: Euryarchaeota
Phylum: Euryarchaeota
Class: Methanopyri
Order: Methanopyrales
Family: Methanopyraceae
Genus: Methanopyrus
Species: M. kandleri
Спецификация из баз данных
Genome accession number: AE009439
ID : 2320
PARENT ID : 2319
RANK : species
GC ID : 11
SCIENTIFIC NAME : Methanopyrus kandleri
MISSPELLING : Methaopyrus kandleri
Исследование-расшифровка полного генома Methanopyrus kandleri: ссылка на публикацию.
Мы определили полную 1,694,969-nt последовательность генома Methanopyrus kandleri при использовании подхода "целого отщепления" генома. M. kandleri белки показывают необычно высокое содержание отрицательно заряженных аминокислот, которая могла бы быть адаптацией к высокой внутриклеточной солености. Предыдущий филогенетический анализ РНК 16 дал возможность предложить, что M. kandleri принадлежат к очень древнему роду. [...]
Отличительная особенность М. kandleri - недостаточность белков, вовлеченных в передачу сигналов и регулировании экспрессии гена. Кроме того, M. kandleri, кажется, имеет меньше приобретенных в ходе эволюции генов, чем другие archaea. Эти особенности могли бы отразить чрезвычайную среду обитания этого организма.
|