|
|
|
|
Белок Q08787 SRFAC_BACSU srfAC
Идентификаторы белка в базах данных.
1. Код доступа в БД Uniprot (AC) - Q08787
2. Идентификатор последовательности в БД Uniprot (ID) - SRFAC_BACSU (название исходного организма: ВACSU = Bacillus subtilis*)
3. Идентификатор gene_name - srfAC
4. Идентификаторы записей PDB - 1JMK
Источник изображения: www.ebi.ac.uk
5. Последовательность аминокислот в формате fasta (длина белка - 1234):
>sp|Q08787|SRFAC_BACSU Surfactin synthase subunit 3 OS=Bacillus subtilis GN=srfAC PE=1 SV=2
MSQFSKDQVQDMYYLSPMQEGMLFHAILNPGQSFYLEQITMKVKGSLNIKCLEESMNVIM
DRYDVFRTVFIHEKVKRPVQVVLKKRQFHIEEIDLTHLTGSEQTAKINEYKEQDKIRGFD
LTRDIPMRAAIFKKAEESFEWVWSYHHIILDGWCFGIVVQDLFKVYNALREQKPYSLPPV
KPYKDYIKWLEKQDKQASLRYWREYLEGFEGQTTFAEQRKKQKDGYEPKELLFSLSEAET
KAFTELAKSQHTTLSTALQAVWSVLISRYQQSGDLAFGTVVSGRPAEIKGVEHMVGLFIN
VVPRRVKLSEGITFNGLLKRLQEQSLQSEPHQYVPLYDIQSQADQPKLIDHIIVFENYPL
QDAKNEESSENGFDMVDVHVFEKSNYDLNLMASPGDEMLIKLAYNENVFDEAFILRLKSQ
LLTAIQQLIQNPDQPVSTINLVDDREREFLLTGLNPPAQAHETKPLTYWFKEAVNANPDA
PALTYSGQTLSYRELDEEANRIARRLQKHGAGKGSVVALYTKRSLELVIGILGVLKAGAA
YLPVDPKLPEDRISYMLADSAAACLLTHQEMKEQAAELPYTGTTLFIDDQTRFEEQASDP
ATAIDPNDPAYIMYTSGTTGKPKGNITTHANIQGLVKHVDYMAFSDQDTFLSVSNYAFDA
FTFDFYASMLNAARLIIADEHTLLDTERLTDLILQENVNVMFATTALFNLLTDAGEDWMK
GLRCILFGGERASVPHVRKALRIMGPGKLINCYGPTEGTVFATAHVVHDLPDSISSLPIG
KPISNASVYILNEQSQLQPFGAVGELCISGMGVSKGYVNRADLTKEKFIENPFKPGETLY
RTGDLARWLPDGTIEYAGRIDDQVKIRGHRIELEEIEKQLQEYPGVKDAVVVADRHESGD
ASINAYLVNRTQLSAEDVKAHLKKQLPAYMVPQTFTFLDELPLTTNGKVNKRLLPKPDQD
QLAEEWIGPRNEMEETIAQIWSEVLGRKQIGIHDDFFALGGHSLKAMTAASRIKKELGID
LPVKLLFEAPTIAGISAYLKNGGSDGLQDVTIMNQDQEQIIFAFPPVLGYGLMYQNLSSR
LPSYKLCAFDFIEEEDRLDRYADLIQKLQPEGPLTLFGYSAGCSLAFEAAKKLEEQGRIV
QRIIMVDSYKKQGVSDLDGRTVESDVEALMNVNRDNEALNSEAVKHGLKQKTHAFYSYYV
NLISTGQVKADIDLLTSGADFDMPEWLASWEEATTGVYRVKRGFGTHAEMLQGETLDRNA
EILLEFLNTQTVTVS
Белок Q08787 интегрирован в базу данных UniProtKB/Swiss-Prot: 1 февраля 1995 г.
Последние внесенные изменения: 10 августа 2010
История внесения изменений: UniProtKB Entry Q08787
Общие сведения:
Функция: вероятно активирует лейцин.
Со-фактор связывает 1 фосфопантатеин (phosphopantetheine) ковалентно.
Биосинтез антибиотика.
Общие черты последовательности принадлежат АТФ-зависимой AMP-binding связывающий ферменты.
Источники:
__________________________________________* Bacillus subtilis — грамположительная, спорообразующая аэробная почвенная бактерия. Первоначально были описаны в 1835 Эренбергом как Vibrio subtilis, в 1872 были переименованы Коном в Bacillus subtilis. Название «сенная палочка» вид получил из-за того, что накопительные культуры этого микроорганизма получают из сенного экстракта. Является продуцентом некоторых полипептидных антибиотиков а также ферментов (амилазы, протеазы) получаемых промышленно.
Биологические свойства
Палочковидная бактерия, размер 3-5x0,6 мкм. Споры овальные, не превышающие размер клетки, расположены центрально. Перитрихиальное расположение жгутиков, подвижная. Колонии сухие, мелкоморщинистые, бархатистые, бесцветные или розовые. Край колонии волнистый. Растет на МПА, МПБ, а также на средах, содержащих растительные остатки, простых синтетических питательных средах для гетеротрофов. Хемоорганогетеротроф, аммонифицирует белки, расщепляет крахмал, гликоген. Условно патогенна для человека.
Геном
Bacillus subtilis штамма 168 представлен кольцевой двуцепочечной молекулой ДНК размером 4214814 п.н. и содержит 5279 генов, из которых 5163 кодируют белки, процент % Г+Ц пар составляет 43,51 %, геном содержит по крайней мере два ori сайта (сайта начала репликации). Изучено биологическое разнообразие штаммов Bacillus subtilis на уровне генома, гены, отвечающие за синтез антибиотиков, синтез клеточной стенки, споруляции, и прорастания спор являются высоковариабельными.
Использование в промышленности
B. subtilis является важным продуцентом протеаз, амилаз, аминокислот и некоторых полисахаридов. В частности, протеаза используется как компонент моющих средств и для удаления волос при производстве кож. Также является продуцентом полипептидных антибиотиков. Ввиду наличия антагонистических свойств против фитопатогенов используется в биозащите растений.
Источники:
- http://www.epa.gov/oppt/biotech/pubs/fra/fra009.htm
- http://microbewiki.kenyon.edu/index.php/Bacillus_subtilis - с картинками
|