Краткое описание белка археи Methanosarcina acetivorans C2A

  • Название белка - rubredoxin
    • Таблица 1. Описание рубредоксина из генома археи Methanosarcina acetivorans C2A
    Параметр Значение
    Идентификатор белка NP_616587.1
    Идентификатор GI 20090512
    Идентификатор генома NC_003552
    Координаты гена в геноме 1990792..1991310
    Длина гена (в парах нуклеотидов) 519
    Цепь (прямая или обратная) прямая
    Длина белка (в аминокислотных остатках) 172

    Последовательность аминокислотных остатков

                                                                             
>gi|20090512|ref|NP_616587.1| rubredoxin [Methanosarcina acetivorans C2A]
MSEEEVDKVYRRLNQEVEKSGYHLNPDVEFTKELVRGLLANERRYGYWSCPCRLSADNK
EEDLDIICPCYYRDPDLNDYGACYCALYVSDEVIRGEKEVESIPERRPPREKREAIRAE
EASRAEMMETMEFTGKLSKPVWRCKVCGYLCAMDEAPGVCPICKARKERFERFM

    Геномное окружение белка рубредоксина

    Старт-кодоном данного белка является TTG (кодон ATG, расположенный в последней трети гена не является стартовым). Кроме того,можно заметить, что в верхней рамке нет стоп-кодона.

    Рисунок 1. Геномное окружение белка NP_616587.1


    © Васильева Елена, 2015