Краткое описание вируса Aspergillus foetidus dsRNA mycovirus
Вирус Aspergillus foetidus dsRNA mycovirus поражает грибы из рода Aspergill. Известно о возникновении заболеваний грибов, но не обнаружено цитопатических или токсических эффектов. Признак заражения - высокое содержание галактозамина в клеточной стенке[1]. Вирус A.foetidus содержит по меньшей мере два икосаэдрических типов частиц размером 25-50 нм, названные AfV-S(slow) and AfV-F(fast), по относительной электрофоретической подвижности. Также известно, что он содержит двухцепочечную РНК [2] .
Таблица 1. Основные параметры генома вируса Aspergillus foetidus dsRNA mycovirus| Значение | |
| Латинское название вируса | Aspergillus foetidus dsRNA mycovirus |
| Русское название вируса | Вирус аспергилла(Aspergillus foetidus) с дцРНК |
| Количество фрагментов в полном геноме | 4 |
| Общая длина генома (п.н.) | 10855 |
| Количество кодируемых в геноме белков | 4 |
Последовательность белка
>YP_007353984.1 hypothetical protein
MRSVQIVLENARYAASLAEARHYLGDEPFWWGSLAEGRHALSHLSAGNDDTSRCLSK
LWSPRSFWVPSFTPKGFPLICVSSAALASKYCSLLRSFDLDVEIASDLRALAARLFRG
ICVYVVADTFSSPFYAFESDAPPEELVSWLRNPYDLGCPHSDAYTKFRASRIFRTEDV
WGELGAWPWGDLEKALGEIEVKERVIDPELWARMWHELDAGRASRALFWADSLWNRER
RFRQRHYFDLCSLYIVVHGVWSKEGAGDLFRLIAEQILHEMLVAMSYERMYFTCFWLW
TTQYWSSLCQYVLKTRLLHATAAQWTAICKETTAVVTQTWMFPLTNRQHIASAYFLNA
EDLNGFSDADAMKGEVTVEVLKYALNEFKYTYPSIEGRTFDAYLQELLSAATSLLEPI
YKTYADKAKTWDEFISLRSAWAAGGVAGRRSRDVLGNQVSPPGAAKAYVMTMTEKQQW
AMDWGKLYIEIAGKLDERGVDRTLSATDMRDQTAESYVFHPLRSRYPVVGLDIGESPA
ETMGRHINLIAASEGPAHYLSDGRILVAWDWSKWDHYVHVAEHMVVLKAMRQLIRRYI
RQEVATDMLREIDRIEEGHRVAIFRCQAYADDHYSRVVDEIIKGSGGRARRVGDTAVE
VTNPAGQQSGRRTTLEVNTIIGTSRLLVRDSELLGRGASLRSRTSMYVLNRADDVAEV
FRKYQEGKAAVEKMLEQGHLANPKKQVAQWRSIVYFRILYAGGAMRPFPPRAVYAAAS
GHPNKGSGGELDAISKLRSISSGLEMWARRGGWLGMARALYDDERFFSKTRVWTRACH
LNPKHPPDVVRLSPALLHAAPENGGAGILPVGVYEYDYRIKAGRGKYELDAQYWRKLA
DDYANAHGRGPGLVDLEANASSWVARATGVTPTARDSLEFQRKWAAGRAQQDGEGIMI
TWLRNAAICDAVRTTHVDKSSSGHKFDWESWSVRACLLRFKQALQRARRAIGAAEVTE
TIRDIRGPPAYGMFKSQYYGYASIIYRNSGKDPGVLRSLAGGSALGRDYLAQSGPFPD
WLKVMHLEGKLGAAGAWHKLLPPSWAGWLDATVSKALFETCLRLPNVRASKYQVLMTR
SRVTSFAVQMFRHAFPHLFLH
|
Ссылки
1. D.J.Border, K.W.Buck, E.B.Chain,G.F.Kempson-Jones, P.Lhoas, and G.Ratti, Viruses of Penicillium and Aspergillus species, Biochem J. 1972 Apr; 127(2): 4P–6P
2. Kozlakidis Z., Herrero N., Ozkan S., Bhatti M.F., Coutts R.H., A novel dsRNA element isolated from the Aspergillus foetidus mycovirus complex, Arch Virol. 2013 Dec;158(12):2625-8