Измерение торсионных углов белка GDEASE_BASCU (PBD ID 1WKQ)

1. Таблица. Измерение торсионных углов остатка ALA10 в белке GUAD_BACSU, цепь А

Название двугранного угла	Угол определяется по координатам атомов	Данный угол описывает поворот вокруг связи	Результат измерения с помощью RasMol
φ	ALA10:A.C (карбонильный углерод 10-го остатка цепи А) ALA10:A.CA (альфа-углерод 10-го остатка цепи А) ALA10:A.N (азот 10-го остатка цепи А) ARG9:A.C (карбонильный углерод 9-го остатка цепи А)	Calphai-Ni	-62,67
ψ	ALA10:A.N (азот 10-го остатка цепи А) ALA10:A.CA (альфа-углерод 10-го остатка цепи А) ALA10:A.C (карбонильный углерод 10-го остатка цепи А) VAL11:A.N (азот 11-го остатка цепи А)	Calphai-C'i	-41,14
ω	ALA10:A.O (кислород 10-го остатка цепи А) ALA10:A.C (карбонильный углерод 10-го остатка цепи А) VAL11:A.N (азот 11-го остатка цепи А) VAL11:A.CA (альфа-углерод 11-го остатка цепи А)	C'i-Ni+1	-2,08

2. Изображение, иллюстрирующее определение угла φ



Изображение можно получить скриптом

3. Построение карты Рамачандрана для следующих множеств аминокислотных остатков

Карты Рамачандрана для белка построены с помощью MS Excel (Carta.xls)