Эволюционная модель
Исследована скобочная структура:(A:90, (((B:25,C:25):10,D:35):5,(E:30, F:30):10):50)
Ей соответствует дерево:
Исходными данными для построения дерева была скобочная структура и название белка...
Был создан скрипт-файл, который при запуске активировал программу, способную
сгенерировать последовательности согласно дереву. Ниже приведен скрипт-файл:
msbar tolc.fasta aaa.fasta -point 4 -count 1339 -auto
msbar tolc.fasta tolc2.fasta -point 4 -count 745 -auto
msbar tolc2.fasta tolc3.fasta -point 4 -count 70 -auto
msbar tolc2.fasta tolc4.fasta -point 4 -count 149 -auto
msbar tolc3.fasta tolc5.fasta -point 4 -count 149 -auto
msbar tolc5.fasta bbb.fasta -point 4 -count 373 -auto
msbar tolc5.fasta ccc.fasta -point 4 -count 373 -auto
msbar tolc3.fasta ddd.fasta -point 4 -count 521 -auto
msbar tolc4.fasta eee.fasta -point 4 -count 447 -auto
msbar tolc4.fasta fff.fasta -point 4 -count 447 -auto
Эволюционные расстояния между нуклеотидными последовательностями
Сравнение методов реконструкции деревьев
Анализ филогенетических деревьев