Учебный сайт Мухалевой Лизаветы

Файл результатов РСА экспериментов

Для выполнения данного практикума был скачен файл со структурными данными для белка предполагаемой эндо-1,4-бета-глюконазы (PDB ID 1VHE) из базы данных PDB в формате .cif и был переведён в формат .xslx (файлы доступны для скачивания по ссылкам).

В файле оказалось 38362 структурных фактора, из которых использованных для оптимизации модели (это те, что в колонке стоит "o"), только 36441 штуки. 37558 фактора имеют силу сигнала большую или равную 3, то есть его измерение считается хорошим, так как его значение в три раза или больше превосходит средне квадратичное нескольких его измерений (соответствующая колонка расчетов в таблице excel - "good").

Также в данном файле со структурными данными были "пропущенные" тройки h,k,l. Это значит, что тройки нет среди измеренных структурных факторов,но есть измеренный структурный фактор (h',k', l') с h'>=h, k'>=k, l'>=l. Примеры таких троек: 0,1,1; 0,1,2; 0,1,3; 0,2,2; 0,2,3.

© Mukhaleva Elizaveta, FBB MSU, 2016
Дата последнего изменения: 25.12.2016

Valid HTML 4.01 Strict Правильный CSS!