Внутримолекулярные взаимодействия в белке AHBA synthase

Остовые водородные связи белка AHBA synthase
Главная	Водородные связи в α-спирали Рассмотрим водородную связь между двумя атомами в составе α-спирали (рис.1). В данном случае доноры водорода - атомы азота, а акцептопры - атомы кислорода. Разница между номерами остатков, участвующих в образовании одной водородной связи равна трем или четырём. Рис. 1. α-спираль белка AHBA synthase. В состав спирали входят аминокислотные остатки 89-98 включительно. Атомы кислорода покрашены красным цветом, азота - синим, а углерода - серым. Изображение получено с помощью программы Jmol. Водородные связи в β-листе Рассмотрим водородные связи в β-листе (рис.2). Аминокислотные цепочки ориентированы друг относительно друга параллельно. При этом достигается меньшая прочность связей, чем при антипараллельной ориентации, из-за их меньшего числа на единицу длины. Рис.2. β-лист белка AHBA synthase. В состав структуры входят 127-131, 80-84, 101-105 (сверху вниз) аминокислотные остатки. Аминокислотные остатки выделены согласно типу атомов (красный – кислород, синий – азот, серый – углерод). Картинка в левом верхнем углу демонстрирует взаимную направленность цепей, образующих β-лист. Изображение получено с помощью программы Jmol Внутримолекулярные взаимодействия боковых цепей Гидрофобные взаимодействия
Семестры Первый семестр Второй семестр Третий семестр Четвертый семестр
Обо мне
Ссылки