Гидрофобный кластер в составе белка

Изображение гидрофобного ядра белка приведено на рис.1. В его состав входят C и S атомы, не связанные с полярными. Была выполнена следующая команда для выделения гидрофобнымх аминокислот:

select hfprot

Где hfprot это группы гидрофобных атомов, определённая в скрипте atom-types.spt .

Остовые водородные связи

Внутримолекулярные взаимодействия боковых цепей