Практикум 3.

1.Структура в целом

Представленный тип макромолекулы - белок НАД киназа 1,выделенный из Listeria monocytogenes EGD-e,палочковидной патогенной бактерии, способной размножаться в продуктах питания и в случае попадания в организм человека, паразитировать в клетках. Белок состоит из 1 полимерной цепи ( А-цепь ).В биологическую единицу входят четыре цепи (гомотетрамер).

1.1.Общий вид хода остова полимерной цепи.

2.Отдельные цепи

Данная макромолекула относится к Listeria monocytogenes EGD-e.

Ее uniprot_id - Q8Y8D7. Функция: Участвует в регуляции внутриклеточного баланса NAD и NADP, а также является ключевым ферментом в биосинтезе NADP. Катализирует фосфорилирование 2'-гидроксила аденозинового молекула NAD с образованием NADP. Каталитическая активность: ATP + NAD+ = ADP + H+ + NADP+

Мутаций нет.

Модифицированных аминокислотных остатков нет.

1.2.Белок, окрашенный по типу вторичной структуры.

3.Малые молекулы

В структуре белка присутствуют следующие типы малых молекул:

ID: K2K Name: (2~{R},3~{R},4~{S},5~{R})-2-(6-aminopurin-9-yl)-5-[[4-(6-azanyl-9~{H}-purin-8-yl)but-3-ynylamino]methyl]oxolane-3,4-diol Formula: C19 H21 N11 O3 Фрагменты pdb-файла: K2K

ID: CIT Name: CITRIC ACID Formula: C6 H8 O7 Фрагменты pdb-файла:CIT

1.3.Белковое окружение лиганда K2K.

4. Pесурсы

PDB-файл белка

Uniprot

сайт про белок